Calleja var arrangör och chef för den centrala armén (1810-12) under självständighetskriget och den sextiode underkungen i Nya Spanien, som regerade från 1813 till 1816, var en av de stora skurkarna i Mexikos historia.
Han föddes i Medina del Campo, Valladolid och dog i Valencia. Han gjorde sin första kampanj som andra löjtnant i den misslyckade Alger-expeditionen, som under Charles III leddes av greve O'Reilly. Han var en lärare och kapten för ett företag med 100 kadetter, varav Joaquín Blacke, regent efter Spanien, och Francisco Javier de Elío, framtida vicekonge i Buenos Aires, vid militärskolan i Puerto de Santa María.
Han anlände till Nya Spanien med den andra räkningen av Revillagigedo (1789), som kapten knuten till det fasta infanteriregementet i Puebla, och utförde framgångsrikt flera uppdrag tills han utsågs till befälhavare för San Luis Potosí-brigaden. Han hade där under sitt kommando truppens kanton beordrad att samlas av underkonge Marquina, som kapten Ignacio Allende deltog i tillsammans med sitt kompani. Där gifte han sig också med Doña Francisca de la Gándara, dotter till den kungliga banan i staden, som var ägare till den stora Hacienda de Bledos; och han fick stort inflytande på folket i landet, som kände honom som "mästaren Don Félix."
När Hidalgos uppror inträffade utan att vänta på order från vicekungen, satte han trupperna från sin brigad på armarna, ökade dem med nya och organiserade och disciplinerade dem, han bildade den lilla (4000 man) men mäktiga armén i centrum, som lyckades besegra centrumet Hidalgo och möt den formidabla offensiven som Morelos startade.
Calleja drog sig tillbaka till Mexiko efter belägringen av Cuautla (maj 1812), han hade i sin bostad (Casa de Moncada, senare kallad Palacio Iturbide) sin lilla domstol där missnöjen med Venegas regering instämde, som de anklagade för att de saknade pengar och maktlös att innehålla och avsluta revolutionen. Cirka fyra år senare styrde han landet som underkung. Han fullbordade armén genom att få den att nå 40000 man av linjetrupper och provinsiella milisar, och så många av kungar som organiserades i alla städer och gods, några av dem lämnade mest från provinserna själva som var i revolution; han omorganiserade statskassan, vars produkter ökade med nya skatter; den återupprättade den kommersiella trafiken med de frekventa konvojerna som cirkulerade igen från ena änden av riket till en annan och den vanliga posttjänsten; och växte prestations- och tullprodukterna.
Detta antar de kontinuerliga och intensiva kampanjer som han främjade mot upprorerna, där Morelos gav efter. En beslutsam och skrupellös man, han stoppade inte sig själv i media och stängde ögonen för de övergrepp som hans befäl hade begått, om de tjänade den verkliga saken med iver. Han gjorde sig således hatsk mot sina samtida.
Återvänt till Spanien fick han titeln greve av Calderón (1818) och de stora korsen Isabel la Católica och San Hermenegildo. Efter att ha varit generalkapten i Andalusien och guvernör i Cádiz hade han befäl över Sydamerikas expeditionstrupper, som stod upp innan de lämnade och reducerade honom till fängelse (1820). Släppt vägrade han regeringen i Valencia och fängslades återigen på Mallorca fram till 1823. "Renad" 1825 stannade han kvar i kasernen i Valencia till sin död.
