Erövringen av Oaxaca var relativt fredlig, eftersom Zapotec- och Mixtec-herrarna trodde att de skulle hitta européerna de allierade de behövde för att besegra aztekerna.
Å andra sidan motstod andra grupper som zapotecerna i Sierra, Chontales och särskilt blandningarna och genomförde en uppföljare av uppror. Efter deras seger och fortfarande på 1500-talet avskalade spanska de infödda i sina länder och legaliserade denna handling genom kuponger, mercer och splittringar som beviljats av kungen, och skisserade därmed från början av den spanska erövringen, obalansen och ojämlikhet som skulle råda mellan det spanska och det inhemska samhället.
Kolonisatorernas övergrepp var så omfattande att en stor del av det arbete som utfördes av de två Audiencias och vicekungen Antonio de Mendoza syftade till att begränsa kraften hos markisen i Valle de Oaxaca, Hernán Cortés och encomenderos. De föreslog således att stärka den kungliga myndigheten och det var därför de nya lagarna (1542) utfärdades och en komplex administration skapades. Uppdraget att evangelisera i Mixtec- och Zapotec-området var den Dominikanska ordningens arbete som byggde, med i princip inhemskt arbete, överdådiga kyrkor och kloster på de platser där de stora befolkningscentren koncentrerades, såsom staden Antequera, Yanhuitián och Cuilapan. .
Den andliga erövringen var mer radikal och våldsam än den militära erövringen. För att bibehålla befolkningskontrollen behöll erövrarna, med modifieringar, vissa inhemska strukturer på ett sådant sätt att några av cheferna i Oaxaca-dalen och Mixteca Alta lyckades bevara forntida privilegier och egenskaper; I stället försökte missionärerna för att omvandla Amerikas folk till kristendomen att förstöra alla spår av religionen i den spansktalande världen.
Trots den inhemska befolkningens demografiska nedgång, orsakad av epidemier och misshandel, var 1500-talet en ekonomisk tillväxt på grund av införandet av nya tekniker, grödor och arter. I Mixteca uppnåddes till exempel goda vinster genom exploatering av silkesmaskar, nötkreatur och vete. Utvecklingen av stadsmarknaden och gruvorna bidrog till denna tillväxt.
Detta välstånd avbröts emellertid av problemen som gruvdrift mötte sedan 1590. Handeln mellan Sevilla och Amerika minskade och befolkningsminskningen orsakade att konsumtionen i städerna minskade och arbetskraften minskades till sitt minimala uttryck.
Under 1600-talet var den ekonomiska depressionen när de definierade de koloniala strukturerna, dominanssystemet konsoliderades och mekanismerna för en beroende ekonomi etablerades. Tillämpningen av ett monopol och ett centraliserat kommersiellt system hindrade regional ekonomisk utveckling och orsakade områden som var så rika som Oaxaca-dalen att orientera sin ekonomi mot självförsörjning trots vikten av produktion och handel med kakao, indigo och cochineal. .
Redan under andra hälften av 1600-talet började Nya Spaniens ekonomi förbättras: gruvproduktionen fick en återhämtning, handeln med Centralamerika och Peru tilläts igen och den inhemska befolkningen började återhämta sig. Vid denna tid ägnade sig spanjorerna som bodde i Mixteca och i Oaxaca-dalen till boskapsuppfödning i stora proportioner och haciendorna kombinerade framgångsrikt produktionen av vete och majs med uppfödning av boskap. Den koloniala ekonomin omstrukturerades mellan 1660 och 1692 och lade grunden för upplysningskvället.
Nya Spanien växer och blomstrar under upplysningstiden. Territoriet fördubblas, befolkningen tredubblas och värdet av ekonomisk produktion är sexfaldigt. Det bästa exemplet på dessa framsteg observerades i gruvdrift, en central ekonomisk axel som, även om den fortfarande var förslavande, gick från att arbeta 3 300 000 pesos 1670 till 27 000 000 1804.
Nya Spaniens överflöd manifesteras i den intensiva konstruktionsaktiviteten och flyter över i barockens magnifika byggnad, det var då i Antequera som de bland annat byggde kapellet i radbandet till kyrkan Santo Domingo, kyrkan Soledad, San Agustín och Consolación.
1700-talet var århundradet med modernisering av politiska och ekonomiska reformer som genomfördes av Bourbon-kungarna.
Vid 1800 hade Mexiko blivit ett land med extraordinär rikedom men också extrem fattigdom, majoriteten av befolkningen var knuten till haciendorna och kommunerna, de blev misshandlade på arbetsplatserna, förslavade i gruvorna och kvarnarna, utan frihet, utan pengar. och utan chans att förbättra.
Halvspanskarna monopoliserade politisk och ekonomisk makt; Sådana förhållanden med social, ekonomisk och politisk ojämlikhet ackumulerade spänningar och missnöje. Å andra sidan skakar effekterna av händelser som den franska revolutionen, USA: s oberoende och den engelska industriella revolutionen det amerikanska samvetet och tanken på Nya Spaniens självständighet börjar ta form i kreolerna.
