Historien om staden som ursprungligen kallades Nya Galiciens kungarike fortsätter.
Det finns också Santo Tomás de Aquinos gamla jesuitkollegium, byggt under det senaste decenniet av 1500-talet och som 1792 ockuperades av universitetet. Av konstruktionen återstår bara det som var kyrkan med dess monumentala kupol från förra seklet och det bifogade Loreto-kapellet, byggt 1695 av Juan María de Salvatierra. San Juan de Dios-templet, som tidigare var kapellet Santa Veracruz, byggt på 1500-talet av Don Pedro Gómez Maraver, byggdes på 1700-talet med en barock fasad med nykter egenskaper. Kyrkan La Merced, med en barockstil som liknar San Juan de Dios, även om den är mer utsmyckad, grundades på 1600-talet av bröderna Miguel Telmo och Miguel de Albuquerque.
Templet La Soledad byggdes mot slutet av 1600- och början av 1700-talet på begäran av Juana Romana de Torres och hennes man, kapten Juan Bautista Panduro. På platsen var broderskapet till Our Lady of Solitude and the Holy Sepulcher, som ockuperade ett kapell tillägnad San Francisco Xavier. San Diego tempel och skola, verk från århundradet XVII; den första med en mycket nykter dörröppning som redan verkar tillhöra den neoklassiska stilen och den andra med en vacker arkad som pryder dess gamla kloster.
Jesús Marias kyrka, fäst vid klostret med samma namn, grundades 1722; den bevarar fortfarande sina barockfasader där du kan se stora skulpturer som representerar den heliga familjen, Jungfruens ljus, Saint Francis och Saint Dominic.
Slutligen är det viktigt att lyfta fram ytterligare tre religiösa konstruktioner som har framkommit som de bästa exemplen, var och en i sitt slag, på utvecklingen av kolonial arkitektur i Guadalajara, främst mellan 1600- och 1700-talen. Således har vi Aránzazu-kapellet, från mitten av 1700-talet, med sitt nyfikna klockstapel och dess inredning dekorerad med magnifika målningar och Churrigueresque altartavlor från samma period och anses vara de bästa i staden. Klostret och kyrkan Santa Mónica, grundad av fader Feliciano Pimentel under första hälften av 1700-talet; dess tempel uppvisar en dubbel fasad med rik utsmyckning katalogiserad som det bästa exemplet på den sprudlande soloniska barockstil. San Felipe Neri-templet, byggt 1766 av arkitekten Pedro Ciprés, bildar en utomordentligt nykter ensemble som innehåller element med plateresiska påminnelser i sin utsmyckning, en aspekt som placerar templet som den bästa religiösa byggnaden i Guadalajara.
I konstruktionerna som motsvarar civil arkitektur finns det några beundransvärda byggnader, bland vilka vi kan nämna regeringspalatset, gamla kungliga hus som modifierades på 1700-talet efter ett projekt av militäringenjören Juan Francisco Espino, även om fasaden var arbete av Miguel José Conique. Byggnaden är huvudsakligen utformad i barockstil, men vissa neoklassiska tendenser märks redan i den. De kungliga kontoren, som var i det försvunna Palacio de Medrano, och rättssalen fungerade på platsen.
Vi har också det som var Conciliar Seminary tillägnad San José, invigt av biskop Galindo y Chávez 1701, idag ockuperat av Regional Museum of Guadalajara, med dess huvudsakliga kloster av toskanska stilkolonner och dess barocka dörröppningar. Den berömda Hospicio Cabañas byggdes i början av 1800-talet, enligt planerna för den berömda arkitekten Manuel Tolsá, regisserade arbetet José Gutiérrez och slutfördes år senare av arkitekten Gómez Ibarra, och som utgör ett anmärkningsvärt exempel på den nyklassiska stilen.
Bland andra mindre konstruktioner som gav staden Guadalajara stilistisk enhet kan vi nämna, även om inte alla är bevarade: den ståtliga herrgården från 1500-talet som stod framför det som en gång var San Sebastián-torget i kvarteret Analco. Huset på Calle de la Alhóndiga nr 114, för närvarande Pino Suárez. De bostäder som tillhörde Sánchez Leñero-familjen på nr 37 och herr Dionisio Rodríguez på nr 133 på Calle de Alcalde. Calderón-huset, en traditionell kolonial godisaffär som grundades 1729 och ligger på hörnet av de gamla gatorna i Santa Teresa och Santuario, idag Morelos och Pedro Loza; Francisco Velarde, i nyklassicistisk stil, och slutligen den som var herrgården Cañedo, som ligger framför baksidan av katedralen.
Nära Guadalajara, den tredje viktigaste staden i landet, är den gamla staden San Juan Bautista Melzquititlán, idag San Juan de los Lagos. Den här staden har blivit ett viktigt religiöst centrum på grund av den stora mirakulösa traditionen av bilden av Jungfru Maria som bevarar sin basilika, byggd i mitten av 1600-talet av Don Juan Rodríguez Estrada. I samma stad kan du se andra konstruktioner som Temple of the Third Order, Chapel of Golgata, Chapel of the First Miracle, med anor från 1600- och 1700-talen. Det finns också viktiga civila byggnader i befolkningen, såsom College of College och tionde byggnad, bland andra.
I staden Lagos de Moreno kan du se dess viktigaste församling, ett verk från 1600-talet med en vacker fasad i Churrigueresque-stil.
Slutligen finns det i San Pedro Tlaquepaque några exempel på barock religiös arkitektur i regionen, såsom San Pedro socken och Soledad-templet.
