Född i Ozumba, delstaten Mexiko, 1737, omfamnade han en religiös karriär och utsågs till präst vid tjugo års ålder.
Trots sin filosofiska utbildning har han från mycket ung ålder varit intresserad av kunskap och tillämpning av naturvetenskap, fysik, matematik och astronomi. Han publicerar värdefulla verk om vetenskapliga ämnen i tidens tidningar och tidskrifter. Han förvärvar internationellt rykte och utses till motsvarande partner för Paris Academy of Sciences. Han spenderar mycket av sin tid på att genomföra vetenskapliga experiment och monterar ett stort bibliotek. Han är en samlare av arkeologiska bitar och sällsynta exemplar av växter och djur. Utforska Xochicalco. För att hyra honom grundades 1884 Scientific Society Antonio Alzate, som 1935 blev National Academy of Sciences. Hans mest kända redaktionella arbete är anteckningarna till den antika historien i Mexiko av jesuiten Francisco Javier Clavijero. Det sägs att han är en avlägsen släkting till Sor Juana Inés de la Cruz. Han dog i Mexico City 1799.
